把研究上下文放在一起
研究主题、PICO、论文、数据字典、代码和已有结果都归入同一项目,减少跨工具复制与上下文丢失。
MedHelp 把智能体对话、文献追踪、数据库与变量资源、任务流水线、项目文件和计算环境放进同一个研究工作台。本指南覆盖第一次登录到论文与汇报产出的完整路径。
用 5 个步骤完成项目、会话和第一项研究任务。
01 CORE如何对话选会话类型、附加材料、调用技能并获得可执行产物。
02 EVIDENCE查文献与资源从 PubMed 动态到变量证据和数据库字段定位。
03 RECORDS找回对话记录按项目查看、重命名、分享、归档和继续历史会话。
04MedHelp 是围绕临床与生物医学研究生命周期设计的统一工作区。一个研究项目可以同时承载问题讨论、原始材料、文献证据、数据提取、分析代码、图表、论文草稿与任务状态。
研究主题、PICO、论文、数据字典、代码和已有结果都归入同一项目,减少跨工具复制与上下文丢失。
对话会根据任务调用文献、数据库、统计、可视化、写作等科研技能,复杂任务可拆成多阶段任务。
结果不只停留在聊天文本,还可以写入项目文件,形成表格、代码、图、报告、论文与可追踪证据。
截图取自当前产品演示,用于说明典型工作流;界面文字与布局可能随版本、账号权限和窗口尺寸变化。点击图片可查看大图。
先创建项目,再在项目内开始会话。项目是研究资料与产物的容器;会话是一次具体工作过程。把同一研究的所有会话留在同一项目中,后续查找和复现会轻松很多。
如果你刚进入平台,不必先配置所有选项。按下面顺序就能完成一个最小闭环。
注册申请通过后登录。先查看账号是否在有效试用期内;试用剩余时间与实际权限以账号页面显示为准。
项目名建议使用“疾病/主题 + 数据源 + 目标”,例如“ICU 脓毒症早期风险预测”。名称以后仍可修改。
研究设计、文献、数据、统计和论文任务选择“研究会话”;只想询问代码仓库或某个文件时选择“项目问答”。
至少说明人群、暴露/干预、结局、数据源、时间范围和期望输出。信息不足时,智能体会先提出澄清问题。
检查证据来源、变量定义、统计假设和文件路径。让智能体把关键结论写入项目文件,再从任务面板或历史会话继续。
工作台是入口,项目是长期容器,会话是某一轮协作。文件、任务、Git 和终端都围绕当前选中的项目工作。
| 概念 | 用途 | 建议做法 | 常见误区 |
|---|---|---|---|
| 项目 | 保存一个研究主题的长期上下文、文件与会话 | 一项主研究一个项目;名称具体、稳定 | 每问一个问题都新建项目,导致资料分散 |
| 研究会话 | 处理文献、方案、统计、写作等研究任务 | 按可交付任务拆分,例如“变量定义”“主模型” | 把整个研究塞进一条极长会话而不阶段性归档 |
| 项目问答 | 解释代码、文件、模块或定位实现问题 | 提供文件路径或明确要追踪的模块 | 用项目问答触发完整研究规划 |
| 任务/产物 | 追踪五阶段进度和生成文件 | 完成一步就回写文件并更新状态 | 只看聊天结论,不保存关键定义和分析口径 |
账号用于隔离个人工作区、项目、会话与配置。平台可根据运营设置开放直接注册或启用申请审核。
不同账号可能有不同试用期限与权限。请以登录后账号/设置页面显示的“试用到期”信息为准。本指南不承诺固定免费天数或固定额度。
高质量对话的核心不是把提示写得很长,而是把研究边界、可用材料、判断标准和期望产物讲清楚,并让重要结论进入项目文件。
适合研究选题、文献综述、数据库提取、统计建模、图表、论文、基金和学术汇报。会显示研究流程提示与科研技能入口。
适合解释项目文件、追踪代码路径、排查错误和做定点修改。它会聚焦仓库问题,除非你明确要求开始研究规划。
| 要素 | 应该说明 | 示例 |
|---|---|---|
| 目标 | 这轮要解决什么,不要只说大主题 | 比较两个脓毒症定义对 28 天死亡预测的影响 |
| 对象 | 人群、数据源、时间窗、纳排范围 | MIMIC-IV 成人首次 ICU 入院,排除停留不足 24h |
| 变量 | 暴露、结局、协变量和关键时间语义 | 暴露取入 ICU 后 6h 内;结局为 28 天死亡 |
| 标准 | 判断成功的统计、格式或质量要求 | 报告效应量、95% CI、模型诊断和敏感性分析 |
| 产物 | 希望输出聊天答案还是项目文件 | 生成 analysis_plan.md 与 variables.csv |
| 边界 | 不能做什么、哪些信息仍待确认 | 本轮只做方案,不运行全量数据、不编造结果 |
通常按 Enter 发送、Shift + Enter 换行;界面底部会显示当前快捷键。长任务发送前先检查当前项目和模型。
发现方向错误、任务范围过大或可能修改错误文件时立即停止,再明确边界后继续。已生成的部分内容需人工检查。
在同一会话追问可保留上下文;开始独立交付物时新建会话,并引用上一轮沉淀的文件。
智能体可以提高检索、分析和写作效率,但不能替代研究者对研究设计、变量定义、数据质量、统计假设、引用真实性、伦理审批与临床解释的责任。
“文献动态”面向近期医学文献监测。当前核心来源是 PubMed,并可根据版本与配置接入 Europe PMC、medRxiv、arXiv 或内容型来源。正式医学证据应优先核对论文原文与权威数据库记录。
文献动态中发送到对话或形成研究线索时,需要知道要纳入哪个项目。确认页面显示的“当前纳入目标项目”。
填写疾病、队列、暴露、结局或方法学关键词;设置回溯天数、显示条数和最大扫描数。关键词可用中英文及常见缩写。
PubMed 会获取近期带摘要文献并按相关性、时效性、来源信号和摘要质量整理。请求过快可能触发 NCBI 限流。
查看题目、作者、期刊、日期、摘要和评分信号。评分用于辅助排序,不等于证据质量分级,也不能替代全文阅读。
把代表性文献送入当前项目,要求智能体提取 PICO、变量定义、结果和局限;候选变量需人工审核后再沉淀。
文献动态结果取决于检索时间、数据源网络状态与关键词设置。若出现超时或限流,缩小扫描范围、稍后重试,并用 PMID/DOI 到原始数据库核对。预印本不应与同行评议论文等同解读。
资源库用于浏览数据库家族、变量/指标、药物、疾病概念、证据关系和 PubMed 自动发现候选。它帮助定位研究资源,但不代表平台向用户分发任何第三方原始数据。
按中文名、英文名、缩写、数据库、PMID 或临床领域搜索指标,查看新颖性、证据数量与相关概念。
判断指标可能出现在哪个数据库/队列、问卷波次、模块或事件表中,并识别版本与表粒度风险。
结合 PMID、证据句、论文公式和数据字典核对原始字段、派生逻辑、时间窗、单位与缺失编码。
选中变量后发送到当前项目,让智能体给出最小可执行的字段检索、表连接、代码校验和下一步。
| 数据库家族 | 适合问题 | 检索与抽取时重点确认 |
|---|---|---|
| ICU / EHR | MIMIC-III、MIMIC-IV、eICU、NWICU、PIC 等 | patient / admission / stay 粒度、事件表、时间语义、单位、版本 schema;不同版本不可套用同一表结构假设 |
| 全国调查 | NHANES 等复杂抽样调查 | cycle、问卷/体检/实验室模块、合并键、抽样权重、分层与 PSU |
| 大型队列 | UK Biobank 等前瞻性多模态队列 | field、instance、array、基线/重复测量、endpoint source 和访问权限 |
| 国际老龄化 | HRS、SHARE、ELSA、KLoSA、LASI、MHAS 等 | 国家、wave、个人/家庭粒度、代理访谈、权重与跨库可比性 |
| 中国健康/社会调查 | CHARLS、CLHLS、CHNS、CFPS、CGSS 等 | panel 与重复横截面、wave、问卷模块、家庭/个人/社区层级和权重 |
| 金融/收入/劳动力 | CHFS、CHIP、CLDS、CSS 等 | 研究单位、年份口径、收入构成、家庭与个人连接、调查权重 |
能在资源库看到某数据库或变量介绍,不表示当前账号已经获得该数据库原始数据。访问、下载、存储、引用和再分发都必须遵守数据持有方的最新协议和机构要求。
平台内的“知识”不是一个单一页面,而是由项目文件、文献条目、变量证据、会话上下文、研究产物与可选 Zotero 同步共同组成。查找时先判断你要找的是“外部证据”还是“项目内材料”。
| 你要找什么 | 推荐入口 | 推荐操作 |
|---|---|---|
| 最新医学论文 | 文献动态 | 设置主题与回溯时间,筛选后纳入项目对话 |
| 已知论文或引用 | 对话 + 文献技能 / Zotero | 提供 PMID、DOI、标题或 .bib,要求核对元数据与引用 |
| 数据库或变量 | 资源库 | 按数据库、指标、缩写、PMID 或临床领域筛选 |
| 以前讨论过的结论 | 对话记录 / 项目会话 | 按项目、会话名、时间和关键词定位 |
| 项目生成的表、图、代码 | 文件树 / 研究总览 / 产物预览 | 按阶段目录和文件类型查看,并回到对话追问 |
| 团队 SOP 或专用方法 | 科研技能库 | 搜索技能名、能力、领域或标签,查看说明后调用 |
每条研究会话都是项目过程记录。良好的命名和阶段性归档能让团队知道“做过什么、为什么这样做、产物在哪里”。
打开原会话后直接追问,可继承当前会话上下文。若相关文件已移动,重新附加新路径并说明变化。
可生成公开或私有链接。公开链接拿到链接的人即可查看;分享前删除敏感信息并确认访问方式。
会话删除可能不可恢复;项目删除通常先进入回收站。执行前确认关键结论与产物已经写入文件并备份。
对话适合保留过程,但正式变量定义、分析计划、代码、表图和最终文本应保存到项目文件并纳入版本管理。不要把唯一一份关键结果只留在聊天气泡里。
研究流水线用于把“大而模糊”的研究目标拆为证据采集、方案设计、研究执行、报告撰写和成果传播。阶段并非严格单向:发现数据问题时可以回到文献或方案阶段修订。
说明主题、边界、目标期刊/会议、候选数据源、主要方法和评估标准;信息不完整也可以先生成初稿。
请求优先使用 medhelp-pipeline-planner,生成研究简报和按阶段组织的任务列表。
先确认核心约束、主要终点、边界和评估指标。研究简报是后续任务生成与刷新时的重要基线。
查看五阶段进度,点击任务上的“前往对话/在对话中使用”,按优先级执行并生成产物。
完成任务后刷新研究总览,打开产物预览,核对内容、文件路径、阶段归属和下一项任务。
| 阶段 | 至少应有的产物 | 进入下一阶段前要确认 |
|---|---|---|
| 文献 | 检索式、筛选口径、证据矩阵、核心引用 | 证据缺口真实存在;引用可核验;关键定义有出处 |
| 构思 | 研究简报、PICO、DAG/概念模型、变量与分析计划 | 数据可得;主要结局明确;样本量/事件数大致可行 |
| 实验 | 队列流程、分析代码、Table 1、主模型、诊断与敏感性分析 | 代码可运行;时间语义正确;效应量和不确定性完整 |
| 发表 | 主文、图表、补充材料、引用库、检查清单 | 文图表一致;因果表述不过度;符合目标期刊规范 |
| 推广 | 演示文稿、海报、图形摘要或项目网页 | 受众、时长、核心信息和数据披露边界明确 |
MedHelp 不只展示答案,还可以在项目工作区中创建和修改文件、运行命令、查看版本差异并连接计算节点。执行能力取决于部署方式、当前权限和所选模型后端。
浏览、搜索、上传、下载和预览项目文件;可把文件或文件夹加入新对话,让智能体解释、修改或继续分析。
在项目目录运行命令、安装依赖、执行脚本和查看日志。先确认工作目录;删除和覆盖操作需格外谨慎。
查看变更、历史和差异,把研究代码与文本纳入版本控制。提交前检查是否意外包含原始数据、密钥或大文件。
查看本机与已配置节点,按项目需要连接计算环境。项目同步、GPU 和远程节点能力取决于管理员配置。
把文件放回研究流程理解:它来自哪个会话、属于哪个阶段、有哪些相关变更、下一步应做什么。
网页版连接本地工作区时需启动本地 Kernel,并允许浏览器的本地网络访问。状态异常时按页面提示重新检测。
技能是带有方法、边界和执行步骤的科研能力包。你可以让平台自动选择,也可以在对话中指定一个或多个技能。选择越贴近任务,输出通常越稳定。
适合你知道目标但不确定该用哪个技能。清楚描述任务,让平台按研究阶段路由到最小必要技能组合。
从技能快捷方式或技能列表选择,系统会把调用意图写入对话。适合方法和产物已经明确的任务。
直接写“请使用 citation-management 核验引用”。适合熟悉技能名、需要严格控制执行路径的用户。
技能越多不一定越好。统计问题先明确目标,再选择方案、建模、生存分析或机器学习中的最小组合;文献问题也应区分检索、精读、引用追踪和综述。
平台可上传个人/团队技能,并通过 MCP 服务器或插件扩展工具与资源。上传前应检查说明文件、脚本权限、数据访问范围和依赖。来源未知的技能不要直接用于敏感工作区或自动执行高风险命令。
大多数用户可以先使用默认配置。只有在需要自有模型额度、文献同步、外部工具、通知或本地/远程执行时再进入相应设置。
| 设置类别 | 作用 | 注意事项 |
|---|---|---|
| 账号与个人资料 | 头像、账号信息、密码和登录状态 | 不要共用账号;异常时及时修改密码 |
| AI 后端 | Claude、Codex、Gemini 等可用模型与映射 | 模型能力、速度、额度和数据政策不同 |
| API Key | 覆盖服务器默认配置或连接第三方服务 | 只在受控设置中保存,不写入对话/代码仓库 |
| Zotero | 同步全局文献库,支持本地或云端连接 | 本地模式需启动 Zotero 并允许其他应用通信 |
| MCP / 插件 | 为智能体增加工具、资源和团队工作流 | 检查来源、权限、命令和数据流向 |
| Git | 设置提交名称、邮箱和可选 GitHub 认证 | 令牌按用户保存;提交前排除敏感文件 |
| 计算与 Kernel | 连接本地目录、节点和执行环境 | 校验路径存在、网络可达和项目权限 |
| 通知/自动调研 | 设置通知邮箱和完成提醒 | 发送服务与密钥由管理员或用户配置 |
| 外观与预览 | 主题、语言、Markdown 字号等 | 不影响研究内容,仅改变显示 |
把“查文献 + 取数 + 建模 + 写论文”拆成可验收的阶段,减少隐含假设。
例如“本轮不运行全量数据、不推断因果、不编造字段、不写最终结论”。
让智能体区分已核实、推断、缺失和需要人工确认的内容。
优先保留 PMID、DOI、数据集版本和访问日期,并回到原始页面核对。
字段名之外还要确认单位、测量窗口、聚合方式、缺失编码和基线/随访关系。
保存环境、依赖、随机种子、输入输出路径、日志和异常处理。
数据提取和模型运行先用少量记录验证连接、类型、时间窗与输出。
研究简报、变量表、分析计划和最终文本都应归档,避免只存在于对话。
要求汇总修改文件、运行验证、剩余风险和下一步,不要直接跳到新任务。
研究者对伦理、合规、科学判断、临床解释、署名与发表承担最终责任。
MedHelp 提供科研工作区、清洗、统计、建模和 AI 写作辅助。第三方数据库、文献全文和机构数据的所有权、授权与使用边界仍由各数据持有方和相关协议决定。
MIMIC、eICU、NWICU、PIC、UK Biobank、NHANES、SHARE/HRS-family、CHARLS、CFPS、CGSS 等数据库的申请、访问、引用和再分发规则以官方最新条款为准。
用户上传的数据、统计结果、报告、论文草稿和研究产物的权利按适用法律、机构协议和数据来源条款确定。平台处理这些内容仅为提供工作区能力。
上传前完成去标识化与最小化;不要在公开分享、Git、提示词或第三方模型中暴露患者身份、受限字段、密钥和未公开机构信息。
按数据持有方要求引用数据库、版本和访问路径。MedHelp 可被描述为分析工具/工作流平台,不应被标注为第三方数据库的数据来源。
确认伦理审批、数据使用协议、最小权限、存储位置、跨境/跨机构限制、模型服务数据流向、去标识化标准和事件响应流程。若任一项不清楚,暂停上传或执行并咨询本机构负责人。
先确认登录的是正确账号,再刷新项目和会话。检查是否误用了搜索过滤、项目是否在回收站、网络连接是否正常。若使用本地 Kernel,确认 Kernel 正在运行且浏览器允许本地网络访问。
以账号页面显示的到期日和权限为准。试用到期后联系管理员延长试用或开通正式权限。若尚未到期但仍不可用,重新登录并向管理员提供账号、发生时间和页面提示。
先等待当前工具调用完成;若明显卡住,使用停止按钮。可以在设置中重置运行时以中断活跃会话和清空内存缓存;该操作不应删除历史记录。重新开始时缩小任务、减少附件,并检查模型后端登录与额度。
缩短回溯天数、降低最大扫描条数并稍后重试。避免短时间重复请求。记录检索式后也可直接在 PubMed 核验。网络代理不稳定时需要管理员检查服务器连接。
可能是摘要缺失、关键词过宽、文献本身不报告变量定义,或模型 JSON 抽取未完成。先检查检索命中是否相关,再缩小主题、加入指标/终点/评分关键词,必要时手动选择代表性文章精读。
不建议。资源库提供定位线索和证据关系。正式使用前必须在当前数据库版本的数据字典、真实表结构和样本记录中核对字段、连接键、单位、时间窗、缺失编码与派生逻辑。
文件可能被删除、重命名、移动或来自较早项目状态。通过文件树或 Git 历史定位当前路径,再把文件重新附加到会话,并说明旧路径与新路径的对应关系。
在文献动态或文献库中选择条目并发送到当前项目;也可附加 PDF、BibTeX,或直接提供 PMID/DOI。要求先核验元数据,再提取研究设计、变量、结果与局限。
每完成一个交付物就把结论写入文件并做阶段总结。下一项独立任务新建会话,附加上轮产物和简短交接说明。会话名使用“阶段_任务_版本”。
公开链接拿到链接的人都可查看只读快照;私有链接需要登录且受访问控制。任何分享前都要检查患者信息、未公开结果、密钥、路径、机构信息和附件内容,必要时先制作脱敏副本。
网页提供统一界面;桌面端可更紧密地访问本机能力;本地 Kernel 让网页在授权后连接本地工作区与执行环境。实际可用功能由部署方式、操作系统、权限和管理员配置决定。
不能直接视为已验证成果。研究团队必须复核数据、代码、统计假设、效应量、图表一致性、引用真实性、伦理和目标期刊要求,并完成必要的同行审阅与作者确认。